In de spionagewereld is niets wat het lijkt in Obsidian Entertainments RPG-thriller, Alpha Protocol. Spelers kruipen in de huid van Michael Thorton, een bijzonder kundige hoewel onervaren geheimagent getraind om alle bedreigingen van de nationale veiligheid te elimineren. Wanneer een missie gruwelijk in de soep loopt, is Thorton de enige met de informatie, vaardigheden en lef om een internationale catastrofe te voorkomen. Om dat te doen maakt hij gebruik van precies dezelfde regeringsrichtlijn die de vijand tegen hem probeert te gebruiken Alpha Protocol.
Alpha Protocol geeft spelers niet alleen de controle over Thortons acties, maar ook over zijn persoonlijkheid en houding. Dit alles bij elkaar zal de toekomst van de wereld bepalen. Met de razendsnelle gevechten, opmerkelijke personageontwikkeling en innovatieve RPG-functies brengt Alpha Protocol een compleet nieuw perspectief naar het genre. Met een verhaal waar de beste spionagethrillers niet voor onderdoen en een uitgebreide, ultrarealistische spionagewereld tilt Alpha Protocol het RPG-genre een treetje hoger voor de next-gen gamer.